㈠ 芯片分析中的go分析 和 pathway分析 怎么解读
芯片分析中的go分析解读：
基因本体（gene ontology），简称GO，是一种描述基因或基因产物基本特性的词汇，由基因本体协会开发。
GO数据库在建立注释基因和蛋白质知识的标准词汇体系，使各数据库中基因产物功能描述相一致，随着研究的深入，基因本体语义词汇也在不断更新。
Gene Ontology的分析，就是把你的基因的功能归类注释。
芯片分析中的pathway分析解读 ：
Pathway Analysis就是把基因、蛋白或者分子放到“Map”到某个特定的经典代谢或者调控网络，或者自己根据你的分子集的作用关系与功能，形成自己的特异的pathway。这对于阐释分子作用机理，找到Biomarker等非常重要。
1.Pathway功能分析及显着性判断
对差异表达基因进行Pathway功能分析，并计算Pvalue进行显着性判断，Pvalue越小，表明该pathway变化越显着，并可对每条Pathway通路图进行展示，同时在相应的位置标注差异表达基因。
2. Pathway中基因相关性分析
根据每两个基因共出现在同一pathway中的次数统计，绘制基因共相关点线图，进而得到不同pathway上基因的关联情况。在分析工具上点击“cell differentiation”，在“Term Information”中描述了细胞分化术语的基本信息，包括树形及与父结点、子节点关系。
对于未知基因名的序列，可以用序列直接检索GO数据库。点击AmiGO首页上方的“BLAST”，进入检索界面。在检索框输入氨基酸或核酸序列或上传序列文件，检索工具能自动识别并相应地选择BLASTP或BLASTX来与数据库中的序列进行比对。以大肠杆菌DNA聚合酶Ⅱ基因polB为例，“High Scoring Gene Procts”栏内显示基因产物的名称、物种信息、p值。
扩展：
GO的局限性：
GO不是基因序列或基因产物数据库，它强调基因产物在细胞中的功能。
GO是对基因功能的注释，不能反映此基因的表达情况，即是否在特定细胞中、特定组织中、特定发育阶段或与某种疾病相关。
GO不对生物学的每个方面进行描述，如功能域的结构、进化特性等。
㈡ 数据库中 go的用法
GO在SQL Server分析器里用
相当于批处理
GO
xxxx
xxxxx
xxx
GO
一次执行GO里边的所有
㈢ 怎么用origin做go分析图
1、首先打开origin图，可以看到一个表格，分别写上标题、单位、注释和作图的数据。
2、可以直接在origin表格中输入数据或者通过excel表格粘贴到表格中。
3、直接选中X、Y轴要作图的数据。点击表格下方图形类型的快捷按钮，可以得到所要做的图形；或者点击Plot制作图形。
4、得到图形，根据需要还可以改变图形的类型以及对图形进行设置等等。
㈣ 现在的go网不知道怎么操作
您好
如果是需要登陆中国电信欢GO网上营业厅，您只需使用手机号码及服务密码即可登陆。
㈤ 跪求GO分析和PATHWAY分析的详细资料
http://kobas.cbi.pku.e.cn/ 推荐这个网站去做pathway分析，
㈥ 什么是GO富集分析，常说的GO功能分析、功能分析、Pathway分析是什么意思
Gene
Ontology可分为分子功能（
Molecular
Function），
生物过程
（
biological
process）和细胞组成（cellular
component
）三个部分。蛋白质或者基因可以通过ID对应或者序列注释的方法找到与之对应的GO号，而GO号可对于到Term，即功能类别或者细胞定位。
功能富集分析:
功能富集需要有一个参考
数据集
，通过该项分析可以找出在统计上显着富集的GO
Term。该功能或者定位有可能与研究的目前有关。
GO功能分类是在某一功能层次上统计蛋白或者基因的数目或组成，往往是在GO的第二层次。此外也有研究都挑选一些Term，而后统计直接对应到该Term的基因或蛋白数。结果一般以
柱状图
或者
饼图
表示。
1.GO分析
根据挑选出的
差异基因
，计算这些差异基因同GO
分类中某（几）个特定的分支的
超几何分布
关系，GO
分析会对每个有差异基因存在的GO
返回一个
p-value
，小的p
值表示差异基因在该GO
中出现了富集。
GO
分析对实验结果有提示的作用，通过差异基因的GO
分析，可以找到富集差异基因的GO分类条目，
寻找不同
样品的差异基因可能和哪些基因功能的改变有关。
2.Pathway分析
根据挑选出的差异基因，计算这些差异基因同Pathway
的超几何分布关系，Pathway
分析会对每个有差异基因存在的pathway
返回一个p-value，小的p
值表示差异基因在该pathway
中出现了富集。
Pathway
分析对实验结果有提示的作用，通过差异基因的Pathway
分析，可以找到富集差异基因的Pathway
条目，寻找不同样品的差异基因可能和哪些细胞通路的改变有关。与GO
分析不同，pathway
分析的结果更显得间接，这是因为，pathway
是蛋白质之间的相互作用，pathway
的变化可以由参与这条pathway
途径的蛋白的表达量或者蛋白的活性改变而引起。而通过芯片结果得到的是编码这些蛋白质的mRNA
表达量的变化。从mRNA
到蛋白表达还要经过microRNA
调控，翻译调控，
翻译后修饰
（如
糖基化
，
磷酸化
），蛋白运输等一系列的调控过程，mRNA
表达量和蛋白表达量之间往往不具有
线性关系
，因此mRNA
的改变不一定意味着蛋白表达量的改变。同时也应注意到，在某些pathway
中，如EGF/EGFR
通路，细胞可以在维持蛋白量不变的情况下，通过蛋白磷酸化程度的改变（调节蛋白的活性）来调节这条通路。所以芯片数据pathway
分析的结果需要有后期蛋白质功能实验的支持，如Western
blot/ELISA，IHC（
免疫组化
），over
expression
（过表达），RNAi（RNA
干扰），knockout（基因敲除），trans
gene（转基因）等。
3.基因网络分析
目的：根据文献，数据库和已知的pathway
寻找基因编码的蛋白之间的相互关系(不超过1000
个基因)。
㈦ 如何使用cytoscap进行go分析
如何使用cytoscap进行go分析
下例忘记了groups这个参数
{
"jsonrpc": "2.0",
"method": "host.create",
"params": {
"host": "Linux server",
"interfaces": [
{
"type": 1,
"main": 1,
"useip": 1,
"ip": "192.168.3.1",
"dns": "",
"port": "10050"
}
]
},
"id": 3,
"auth": ""
}
返回结果如下，包含的不是result属性而是error属性
{
"jsonrpc": "2.0",
"error": {
"code": -32602,
"message": "Invalid params.",
"data": "No groups for host \"Linux server\"."
},
"id": 3
}
对于获取监控数据来说，比较关心的应该是history.get这个方法。这种方式实际上最终还是由后台数据库获取的。方法提供了丰富的参数，使用非常灵活。但对于一次性大规模的取出大量主机大量监控项的大批数据不太适合。
㈧ 怎样使用HOMER进行GO analysis
复制粘贴和自动翻译真是回答问题的王道啊~~~~~~~~~~~~~~~~~ pfpf
说家人的话要不就具体说是谁 比方说my parents之类 要不就说整体 my family
楼上my folks的说法 应该只是美国才说 英国不会用这么不体面的词汇说自己家人 至少我从来没听到
顺便说 homer如果写作Homer 是那个失明的古希腊诗人荷马 如果小写就是全垒打
Homer sometimes nods是俗谚 意思是就连荷马也有疏忽犯错的时候 跟人非圣贤孰能无过的意思差不多对等
㈨ 如何抓薯仔网的影片
方法一 利用FLVCD下载
1
打开视频下载筛选网站，如在地址中输入“www flvcd com ”(注意输入完整)并按回车，打开该网站：
怎么样下载优酷和薯仔等网站上的视频文件？
2
打开后，在网站中间的文本框中粘贴我们需要下载视频的网站的地址，再单击“开始GO”按钮，网站开始分析视频资源；
3
网站分析资源的速度一般较快，稍后分析完成后我们可以看到结果：
怎么样下载优酷和薯仔等网站上的视频文件？
4
如果视频资源是被分割成多个视频，该工具也能够分析出来，如上图。
END
方法二 利用IE9的捕获功能
1
首先请确认你所使用的IE版本是IE9或以上。打开IE，点击工具栏最右边的“工具”按钮，在弹出的菜单中选择“关于Internet Explorer”命令：
怎么样下载优酷和薯仔等网站上的视频文件？
2
在弹出的“关于Internet Explorer”对话框中，我们可以清楚的查看到当前IE的版本：
怎么样下载优酷和薯仔等网站上的视频文件？
3
确定IE版本为IE9或更高版本时同可以进行后面的操作，否则请先安装IE9或更高版本。注意，IE9需要在WIN7或更高版本的系统上运行。
4
打开IE9，直接按F12键，会打开开发人员工具，在当前窗口的下半部分显示：
5
点击“网络”，再点击“开始捕获”按钮，进入捕获状态，此时“开始捕获”按钮会变成“停止捕获”状态：
怎么样下载优酷和薯仔等网站上的视频文件？
6
切换到“开始捕获”状态后，将音视频网站的网址复制到IE地址栏中打开，或刷新当前音视频网站页面。注意哦，打开捕获后需要重新打开或刷新当前页面哦，要不然不会捕获到资源的；
7
开始正常捕获后，可发现下面列表中会有很多的元素开始在增加。在捕获窗口中，两次单击字段标题栏中的“已接收”或“已花费”按钮，这样就以“已接收”或“已花费”降序排序，我们再按键盘上的Home键跳到最顶部：
怎么样下载优酷和薯仔等网站上的视频文件？
8
等缓冲完毕后,我们可以发现最上面的资源是以M为单位的显示，一般这种以M为单位的就是我们所要的音、视频文件了。如上图中有两个以M为单位的视频资源被捕获到。此时我们可以右击这些资源，从弹出的菜单中选择“复制URL”：
怎么样下载优酷和薯仔等网站上的视频文件？
9
当点击“复制URL”时，迅雷监视会自动监视到刚才复制到的URL，迅雷会自动弹出下载窗口，直接点击“继续”下载即可：
怎么样下载优酷和薯仔等网站上的视频文件？
10
查看迅雷的“正在下载”，我们需要的资源正在被下载：
怎么样下载优酷和薯仔等网站上的视频文件？
END
注意事项
当没有捕获到资源时，应该刷新当前页，再等缓冲完毕；
本方法介绍的是在win7下用IE9的开发工具来捕获视频下载的。