㈠ 晶元分析中的go分析 和 pathway分析 怎麼解讀
晶元分析中的go分析解讀：
基因本體（gene ontology），簡稱GO，是一種描述基因或基因產物基本特性的詞彙，由基因本體協會開發。
GO資料庫在建立注釋基因和蛋白質知識的標准詞彙體系，使各資料庫中基因產物功能描述相一致，隨著研究的深入，基因本體語義詞彙也在不斷更新。
Gene Ontology的分析，就是把你的基因的功能歸類注釋。
晶元分析中的pathway分析解讀 ：
Pathway Analysis就是把基因、蛋白或者分子放到「Map」到某個特定的經典代謝或者調控網路，或者自己根據你的分子集的作用關系與功能，形成自己的特異的pathway。這對於闡釋分子作用機理，找到Biomarker等非常重要。
1.Pathway功能分析及顯著性判斷
對差異表達基因進行Pathway功能分析，並計算Pvalue進行顯著性判斷，Pvalue越小，表明該pathway變化越顯著，並可對每條Pathway通路圖進行展示，同時在相應的位置標注差異表達基因。
2. Pathway中基因相關性分析
根據每兩個基因共出現在同一pathway中的次數統計，繪制基因共相關點線圖，進而得到不同pathway上基因的關聯情況。在分析工具上點擊「cell differentiation」，在「Term Information」中描述了細胞分化術語的基本信息，包括樹形及與父結點、子節點關系。
對於未知基因名的序列，可以用序列直接檢索GO資料庫。點擊AmiGO首頁上方的「BLAST」，進入檢索界面。在檢索框輸入氨基酸或核酸序列或上傳序列文件，檢索工具能自動識別並相應地選擇BLASTP或BLASTX來與資料庫中的序列進行比對。以大腸桿菌DNA聚合酶Ⅱ基因polB為例，「High Scoring Gene Procts」欄內顯示基因產物的名稱、物種信息、p值。
擴展：
GO的局限性：
GO不是基因序列或基因產物資料庫，它強調基因產物在細胞中的功能。
GO是對基因功能的注釋，不能反映此基因的表達情況，即是否在特定細胞中、特定組織中、特定發育階段或與某種疾病相關。
GO不對生物學的每個方面進行描述，如功能域的結構、進化特性等。
㈡ 資料庫中 go的用法
GO在SQL Server分析器里用
相當於批處理
GO
xxxx
xxxxx
xxx
GO
一次執行GO里邊的所有
㈢ 怎麼用origin做go分析圖
1、首先打開origin圖，可以看到一個表格，分別寫上標題、單位、注釋和作圖的數據。
2、可以直接在origin表格中輸入數據或者通過excel表格粘貼到表格中。
3、直接選中X、Y軸要作圖的數據。點擊表格下方圖形類型的快捷按鈕，可以得到所要做的圖形；或者點擊Plot製作圖形。
4、得到圖形，根據需要還可以改變圖形的類型以及對圖形進行設置等等。
㈣ 現在的go網不知道怎麼操作
您好
如果是需要登陸中國電信歡GO網上營業廳，您只需使用手機號碼及服務密碼即可登陸。
㈤ 跪求GO分析和PATHWAY分析的詳細資料
http://kobas.cbi.pku.e.cn/ 推薦這個網站去做pathway分析，
㈥ 什麼是GO富集分析，常說的GO功能分析、功能分析、Pathway分析是什麼意思
Gene
Ontology可分為分子功能（
Molecular
Function），
生物過程
（
biological
process）和細胞組成（cellular
component
）三個部分。蛋白質或者基因可以通過ID對應或者序列注釋的方法找到與之對應的GO號，而GO號可對於到Term，即功能類別或者細胞定位。
功能富集分析:
功能富集需要有一個參考
數據集
，通過該項分析可以找出在統計上顯著富集的GO
Term。該功能或者定位有可能與研究的目前有關。
GO功能分類是在某一功能層次上統計蛋白或者基因的數目或組成，往往是在GO的第二層次。此外也有研究都挑選一些Term，而後統計直接對應到該Term的基因或蛋白數。結果一般以
柱狀圖
或者
餅圖
表示。
1.GO分析
根據挑選出的
差異基因
，計算這些差異基因同GO
分類中某（幾）個特定的分支的
超幾何分布
關系，GO
分析會對每個有差異基因存在的GO
返回一個
p-value
，小的p
值表示差異基因在該GO
中出現了富集。
GO
分析對實驗結果有提示的作用，通過差異基因的GO
分析，可以找到富集差異基因的GO分類條目，
尋找不同
樣品的差異基因可能和哪些基因功能的改變有關。
2.Pathway分析
根據挑選出的差異基因，計算這些差異基因同Pathway
的超幾何分布關系，Pathway
分析會對每個有差異基因存在的pathway
返回一個p-value，小的p
值表示差異基因在該pathway
中出現了富集。
Pathway
分析對實驗結果有提示的作用，通過差異基因的Pathway
分析，可以找到富集差異基因的Pathway
條目，尋找不同樣品的差異基因可能和哪些細胞通路的改變有關。與GO
分析不同，pathway
分析的結果更顯得間接，這是因為，pathway
是蛋白質之間的相互作用，pathway
的變化可以由參與這條pathway
途徑的蛋白的表達量或者蛋白的活性改變而引起。而通過晶元結果得到的是編碼這些蛋白質的mRNA
表達量的變化。從mRNA
到蛋白表達還要經過microRNA
調控，翻譯調控，
翻譯後修飾
（如
糖基化
，
磷酸化
），蛋白運輸等一系列的調控過程，mRNA
表達量和蛋白表達量之間往往不具有
線性關系
，因此mRNA
的改變不一定意味著蛋白表達量的改變。同時也應注意到，在某些pathway
中，如EGF/EGFR
通路，細胞可以在維持蛋白量不變的情況下，通過蛋白磷酸化程度的改變（調節蛋白的活性）來調節這條通路。所以晶元數據pathway
分析的結果需要有後期蛋白質功能實驗的支持，如Western
blot/ELISA，IHC（
免疫組化
），over
expression
（過表達），RNAi（RNA
干擾），knockout（基因敲除），trans
gene（轉基因）等。
3.基因網路分析
目的：根據文獻，資料庫和已知的pathway
尋找基因編碼的蛋白之間的相互關系(不超過1000
個基因)。
㈦ 如何使用cytoscap進行go分析
如何使用cytoscap進行go分析
下例忘記了groups這個參數
{
"jsonrpc": "2.0",
"method": "host.create",
"params": {
"host": "Linux server",
"interfaces": [
{
"type": 1,
"main": 1,
"useip": 1,
"ip": "192.168.3.1",
"dns": "",
"port": "10050"
}
]
},
"id": 3,
"auth": ""
}
返回結果如下，包含的不是result屬性而是error屬性
{
"jsonrpc": "2.0",
"error": {
"code": -32602,
"message": "Invalid params.",
"data": "No groups for host \"Linux server\"."
},
"id": 3
}
對於獲取監控數據來說，比較關心的應該是history.get這個方法。這種方式實際上最終還是由後台資料庫獲取的。方法提供了豐富的參數，使用非常靈活。但對於一次性大規模的取出大量主機大量監控項的大批數據不太適合。
㈧ 怎樣使用HOMER進行GO analysis
復制粘貼和自動翻譯真是回答問題的王道啊~~~~~~~~~~~~~~~~~ pfpf
說家人的話要不就具體說是誰 比方說my parents之類 要不就說整體 my family
樓上my folks的說法 應該只是美國才說 英國不會用這么不體面的詞彙說自己家人 至少我從來沒聽到
順便說 homer如果寫作Homer 是那個失明的古希臘詩人荷馬 如果小寫就是全壘打
Homer sometimes nods是俗諺 意思是就連荷馬也有疏忽犯錯的時候 跟人非聖賢孰能無過的意思差不多對等
㈨ 如何抓土豆網的影片
方法一 利用FLVCD下載
1
打開視頻下載篩選網站，如在地址中輸入「www flvcd com 」(注意輸入完整)並按回車，打開該網站：
怎麼樣下載優酷和土豆等網站上的視頻文件？
2
打開後，在網站中間的文本框中粘貼我們需要下載視頻的網站的地址，再單擊「開始GO」按鈕，網站開始分析視頻資源；
3
網站分析資源的速度一般較快，稍後分析完成後我們可以看到結果：
怎麼樣下載優酷和土豆等網站上的視頻文件？
4
如果視頻資源是被分割成多個視頻，該工具也能夠分析出來，如上圖。
END
方法二 利用IE9的捕獲功能
1
首先請確認你所使用的IE版本是IE9或以上。打開IE，點擊工具欄最右邊的「工具」按鈕，在彈出的菜單中選擇「關於Internet Explorer」命令：
怎麼樣下載優酷和土豆等網站上的視頻文件？
2
在彈出的「關於Internet Explorer」對話框中，我們可以清楚的查看到當前IE的版本：
怎麼樣下載優酷和土豆等網站上的視頻文件？
3
確定IE版本為IE9或更高版本時同可以進行後面的操作，否則請先安裝IE9或更高版本。注意，IE9需要在WIN7或更高版本的系統上運行。
4
打開IE9，直接按F12鍵，會打開開發人員工具，在當前窗口的下半部分顯示：
5
點擊「網路」，再點擊「開始捕獲」按鈕，進入捕獲狀態，此時「開始捕獲」按鈕會變成「停止捕獲」狀態：
怎麼樣下載優酷和土豆等網站上的視頻文件？
6
切換到「開始捕獲」狀態後，將音視頻網站的網址復制到IE地址欄中打開，或刷新當前音視頻網站頁面。注意哦，打開捕獲後需要重新打開或刷新當前頁面哦，要不然不會捕獲到資源的；
7
開始正常捕獲後，可發現下面列表中會有很多的元素開始在增加。在捕獲窗口中，兩次單擊欄位標題欄中的「已接收」或「已花費」按鈕，這樣就以「已接收」或「已花費」降序排序，我們再按鍵盤上的Home鍵跳到最頂部：
怎麼樣下載優酷和土豆等網站上的視頻文件？
8
等緩沖完畢後,我們可以發現最上面的資源是以M為單位的顯示，一般這種以M為單位的就是我們所要的音、視頻文件了。如上圖中有兩個以M為單位的視頻資源被捕獲到。此時我們可以右擊這些資源，從彈出的菜單中選擇「復制URL」：
怎麼樣下載優酷和土豆等網站上的視頻文件？
9
當點擊「復制URL」時，迅雷監視會自動監視到剛才復制到的URL，迅雷會自動彈出下載窗口，直接點擊「繼續」下載即可：
怎麼樣下載優酷和土豆等網站上的視頻文件？
10
查看迅雷的「正在下載」，我們需要的資源正在被下載：
怎麼樣下載優酷和土豆等網站上的視頻文件？
END
注意事項
當沒有捕獲到資源時，應該刷新當前頁，再等緩沖完畢；
本方法介紹的是在win7下用IE9的開發工具來捕獲視頻下載的。